Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FOXO3O43524 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXO3O43524 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXO3O43524 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXO3O43524 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXO3O43524 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXO3O43524 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXO3O43524 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXO3O43524 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXO3O43524 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXO3O43524 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXO3O43524 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXO3O43524 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms