Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf172C9J069 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms