Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGEF1Q9Y6D6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGEF1Q9Y6D6 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGEF1Q9Y6D6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGEF1Q9Y6D6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGEF1Q9Y6D6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGEF1Q9Y6D6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGEF1Q9Y6D6 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGEF1Q9Y6D6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGEF1Q9Y6D6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGEF1Q9Y6D6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms