Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms