Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD1Q9UP38 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD1Q9UP38 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD1Q9UP38 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD1Q9UP38 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD1Q9UP38 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD1Q9UP38 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD1Q9UP38 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD1Q9UP38 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD1Q9UP38 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD1Q9UP38 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD1Q9UP38 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD1Q9UP38 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD1Q9UP38 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD1Q9UP38 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FZD1Q9UP38 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
FZD1Q9UP38 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FZD1Q9UP38 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FZD1Q9UP38 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms