Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AC107884.1-203ENST00000530846 628 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AC130324.1-201ENST00000584157 831 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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