Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms