Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms