Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFHD2Q96C19 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms