Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGP1Q92546 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms