Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMIM5Q71RC9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM5Q71RC9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms