Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTE2Q6XPS3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTE2Q6XPS3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTE2Q6XPS3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTE2Q6XPS3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTE2Q6XPS3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTE2Q6XPS3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTE2Q6XPS3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTE2Q6XPS3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTE2Q6XPS3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTE2Q6XPS3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTE2Q6XPS3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTE2Q6XPS3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTE2Q6XPS3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTE2Q6XPS3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTE2Q6XPS3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTE2Q6XPS3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTE2Q6XPS3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTE2Q6XPS3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTE2Q6XPS3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTE2Q6XPS3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTE2Q6XPS3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTE2Q6XPS3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTE2Q6XPS3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTE2Q6XPS3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTE2Q6XPS3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTE2Q6XPS3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTE2Q6XPS3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTE2Q6XPS3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPTE2Q6XPS3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPTE2Q6XPS3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms