Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD54Q6NXT1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms