Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RSPH4AQ5TD94 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RSPH4AQ5TD94 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms