Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms