Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms