Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDF8

Rhox4f, MCG113261, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4fQ2MDF8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rhox4fQ2MDF8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhox4fQ2MDF8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhox4fQ2MDF8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhox4fQ2MDF8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhox4fQ2MDF8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhox4fQ2MDF8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rhox4fQ2MDF8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms