Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
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