Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTN1Q16799 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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