Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME3Q16798 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME3Q16798 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME3Q16798 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME3Q16798 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME3Q16798 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME3Q16798 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME3Q16798 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME3Q16798 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME3Q16798 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME3Q16798 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME3Q16798 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME3Q16798 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME3Q16798 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME3Q16798 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME3Q16798 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME3Q16798 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME3Q16798 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME3Q16798 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME3Q16798 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ME3Q16798 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME3Q16798 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME3Q16798 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME3Q16798 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ME3Q16798 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME3Q16798 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME3Q16798 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME3Q16798 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME3Q16798 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME3Q16798 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME3Q16798 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME3Q16798 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME3Q16798 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME3Q16798 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME3Q16798 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME3Q16798 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ME3Q16798 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME3Q16798 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME3Q16798 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME3Q16798 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ME3Q16798 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME3Q16798 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME3Q16798 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME3Q16798 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME3Q16798 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME3Q16798 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ME3Q16798 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ME3Q16798 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ME3Q16798 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
ME3Q16798 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ME3Q16798 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ME3Q16798 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME3Q16798 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME3Q16798 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME3Q16798 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME3Q16798 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME3Q16798 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME3Q16798 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME3Q16798 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME3Q16798 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME3Q16798 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ME3Q16798 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME3Q16798 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME3Q16798 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME3Q16798 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME3Q16798 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME3Q16798 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ME3Q16798 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ME3Q16798 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ME3Q16798 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ME3Q16798 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ME3Q16798 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ME3Q16798 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ME3Q16798 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ME3Q16798 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ME3Q16798 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ME3Q16798 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ME3Q16798 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ME3Q16798 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ME3Q16798 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ME3Q16798 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ME3Q16798 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ME3Q16798 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ME3Q16798 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME3Q16798 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME3Q16798 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME3Q16798 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME3Q16798 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME3Q16798 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME3Q16798 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME3Q16798 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME3Q16798 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME3Q16798 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME3Q16798 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME3Q16798 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME3Q16798 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME3Q16798 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME3Q16798 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME3Q16798 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME3Q16798 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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