Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FSCN1Q16658 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FSCN1Q16658 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms