Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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