Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PICALMQ13492 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
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