Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCL9Q07325 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms