Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms