Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XPCQ01831 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
XPCQ01831 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XPCQ01831 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XPCQ01831 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XPCQ01831 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XPCQ01831 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XPCQ01831 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XPCQ01831 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XPCQ01831 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XPCQ01831 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XPCQ01831 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XPCQ01831 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XPCQ01831 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XPCQ01831 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XPCQ01831 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XPCQ01831 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XPCQ01831 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XPCQ01831 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XPCQ01831 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XPCQ01831 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
XPCQ01831 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
XPCQ01831 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XPCQ01831 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XPCQ01831 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XPCQ01831 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XPCQ01831 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XPCQ01831 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XPCQ01831 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XPCQ01831 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XPCQ01831 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XPCQ01831 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XPCQ01831 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XPCQ01831 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XPCQ01831 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XPCQ01831 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XPCQ01831 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XPCQ01831 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
XPCQ01831 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XPCQ01831 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XPCQ01831 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XPCQ01831 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XPCQ01831 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPCQ01831 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPCQ01831 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPCQ01831 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPCQ01831 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPCQ01831 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPCQ01831 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPCQ01831 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPCQ01831 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPCQ01831 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPCQ01831 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPCQ01831 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPCQ01831 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPCQ01831 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
XPCQ01831 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPCQ01831 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPCQ01831 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
XPCQ01831 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPCQ01831 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPCQ01831 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPCQ01831 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XPCQ01831 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPCQ01831 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
XPCQ01831 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPCQ01831 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPCQ01831 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPCQ01831 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPCQ01831 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPCQ01831 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPCQ01831 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPCQ01831 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
XPCQ01831 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPCQ01831 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
XPCQ01831 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
XPCQ01831 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPCQ01831 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPCQ01831 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPCQ01831 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPCQ01831 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPCQ01831 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPCQ01831 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPCQ01831 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
XPCQ01831 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPCQ01831 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPCQ01831 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XPCQ01831 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
XPCQ01831 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
XPCQ01831 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
XPCQ01831 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
XPCQ01831 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XPCQ01831 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XPCQ01831 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XPCQ01831 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XPCQ01831 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XPCQ01831 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XPCQ01831 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XPCQ01831 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XPCQ01831 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms