Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MDM2Q00987 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms