Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms