Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXA10P31260 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms