Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLIP1P30622 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms