Protein–RNA interactions for Protein: P27708

CAD, CAD protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADP27708 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CADP27708 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CADP27708 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CADP27708 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CADP27708 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CADP27708 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CADP27708 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CADP27708 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CADP27708 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CADP27708 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CADP27708 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CADP27708 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CADP27708 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CADP27708 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADP27708 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADP27708 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADP27708 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADP27708 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADP27708 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADP27708 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADP27708 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADP27708 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CADP27708 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADP27708 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADP27708 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADP27708 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADP27708 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADP27708 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADP27708 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADP27708 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADP27708 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADP27708 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADP27708 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADP27708 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CADP27708 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CADP27708 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CADP27708 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CADP27708 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CADP27708 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CADP27708 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CADP27708 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CADP27708 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CADP27708 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CADP27708 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CADP27708 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CADP27708 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CADP27708 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADP27708 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADP27708 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADP27708 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADP27708 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADP27708 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADP27708 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADP27708 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADP27708 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADP27708 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADP27708 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADP27708 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADP27708 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADP27708 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADP27708 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADP27708 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CADP27708 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms