Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPAG9O60271 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2
SPAG9O60271 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPAG9O60271 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SPAG9O60271 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPAG9O60271 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SPAG9O60271 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SPAG9O60271 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms