Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTIFO43310 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTIFO43310 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CTIFO43310 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTIFO43310 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTIFO43310 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTIFO43310 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTIFO43310 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTIFO43310 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTIFO43310 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTIFO43310 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTIFO43310 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTIFO43310 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTIFO43310 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTIFO43310 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTIFO43310 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTIFO43310 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CTIFO43310 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTIFO43310 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTIFO43310 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTIFO43310 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTIFO43310 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTIFO43310 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTIFO43310 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTIFO43310 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTIFO43310 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTIFO43310 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTIFO43310 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTIFO43310 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTIFO43310 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTIFO43310 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTIFO43310 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTIFO43310 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTIFO43310 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTIFO43310 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTIFO43310 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTIFO43310 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTIFO43310 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTIFO43310 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTIFO43310 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTIFO43310 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTIFO43310 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTIFO43310 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTIFO43310 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTIFO43310 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTIFO43310 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTIFO43310 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTIFO43310 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTIFO43310 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTIFO43310 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTIFO43310 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTIFO43310 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTIFO43310 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTIFO43310 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTIFO43310 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTIFO43310 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTIFO43310 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTIFO43310 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTIFO43310 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTIFO43310 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTIFO43310 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTIFO43310 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTIFO43310 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CTIFO43310 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTIFO43310 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTIFO43310 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTIFO43310 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTIFO43310 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CTIFO43310 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTIFO43310 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTIFO43310 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTIFO43310 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTIFO43310 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTIFO43310 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTIFO43310 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTIFO43310 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTIFO43310 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTIFO43310 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTIFO43310 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTIFO43310 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTIFO43310 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
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