Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR3AO14802 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR3AO14802 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms