Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf172C9J069 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms