Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDGFL3Q9Y3E1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms