Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZMYND8Q9ULU4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms