Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms