Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPN3Q9UHW5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms