Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC4Q9NTJ3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMC4Q9NTJ3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMC4Q9NTJ3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMC4Q9NTJ3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMC4Q9NTJ3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMC4Q9NTJ3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMC4Q9NTJ3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMC4Q9NTJ3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMC4Q9NTJ3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMC4Q9NTJ3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SMC4Q9NTJ3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms