Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR33

POLE4, DNA polymerase epsilon subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE4Q9NR33 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLE4Q9NR33 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms