Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP74Q9C0B2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms