Protein–RNA interactions for Protein: Q99459

CDC5L, Cell division cycle 5-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC5LQ99459 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDC5LQ99459 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDC5LQ99459 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CDC5LQ99459 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDC5LQ99459 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC5LQ99459 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms