Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYCBPQ99417 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms