Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms