Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms