Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP50Q70EL3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms