Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC141Q6ZP82 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms