Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms