Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOGA3Q5TF21 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms